多种实验结果已证实，该技术具有很高的敏感性，但是如掌握不好也可带来很高的背景染色，可有多种因素影响到最终产物在酶结合位点的沉积，这是因为这个沉积过程是一种复杂的化学反应和物理变化的综合结果。Breininger等(2000)认为，在ELF的反应过程中很容易形成假的荧光结晶，使FISH信号减弱，引起非特异性结晶沉积在组织细胞表面，造成背景信号。

 

    实验结果证实，只要延长ELF反应时间，就可以避免背景染色。

 

    解决的办法主要有：

    ①商品化试剂盒内提供一种延时试剂；

    ②在显色液中加入4％PVP；

    ③显色时间控制在15～30min内。

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